1、江户川柯南:本故事的主人公。真实身份为高中生侦探工藤新一,由于被黑衣组织的成员灌下毒药APTX4869而导致身体变小,之后化名为“江户川柯南”,为了调查黑衣组织而寄住在毛利侦探事务所。就读于帝丹小学一年级B班,是少年侦探团成员。
2、工藤新一:17岁,帝丹高中二年级B班学生,高中生侦探,被称为“平成年代的福尔摩斯”、“日本警察的救世主”,很多案件在他的活跃之下得以侦破。后来被黑衣组织灌下毒药,身体变小。
3、毛利兰:16岁,本故事的女主角。帝丹高中二年级B班学生,毛利小五郎的女儿,帝丹高中空手道社的主将。毛利侦探事务所的女主人,新一青梅竹马的女友。将柯南像弟弟一样对待。